Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms