Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms