Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIX3O95343 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIX3O95343 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIX3O95343 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIX3O95343 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIX3O95343 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIX3O95343 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIX3O95343 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIX3O95343 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX3O95343 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX3O95343 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX3O95343 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX3O95343 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX3O95343 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX3O95343 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX3O95343 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX3O95343 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX3O95343 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX3O95343 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX3O95343 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX3O95343 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX3O95343 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX3O95343 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIX3O95343 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms