Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL3O95236 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL3O95236 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL3O95236 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL3O95236 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL3O95236 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL3O95236 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL3O95236 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL3O95236 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL3O95236 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOL3O95236 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOL3O95236 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOL3O95236 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms