Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG13O75143 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG13O75143 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG13O75143 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG13O75143 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG13O75143 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG13O75143 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG13O75143 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG13O75143 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG13O75143 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG13O75143 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG13O75143 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG13O75143 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG13O75143 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG13O75143 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG13O75143 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG13O75143 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG13O75143 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG13O75143 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG13O75143 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG13O75143 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG13O75143 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG13O75143 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG13O75143 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG13O75143 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG13O75143 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG13O75143 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG13O75143 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG13O75143 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG13O75143 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG13O75143 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG13O75143 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG13O75143 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG13O75143 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG13O75143 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG13O75143 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG13O75143 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG13O75143 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG13O75143 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG13O75143 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG13O75143 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG13O75143 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG13O75143 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG13O75143 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG13O75143 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG13O75143 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG13O75143 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG13O75143 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG13O75143 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG13O75143 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG13O75143 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG13O75143 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG13O75143 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG13O75143 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG13O75143 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG13O75143 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG13O75143 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG13O75143 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG13O75143 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG13O75143 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG13O75143 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG13O75143 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG13O75143 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG13O75143 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG13O75143 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG13O75143 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG13O75143 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG13O75143 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG13O75143 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG13O75143 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG13O75143 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG13O75143 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG13O75143 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG13O75143 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG13O75143 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG13O75143 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG13O75143 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG13O75143 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG13O75143 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG13O75143 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG13O75143 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG13O75143 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG13O75143 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG13O75143 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG13O75143 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG13O75143 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG13O75143 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG13O75143 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms