Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPLO60437 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPLO60437 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPLO60437 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPLO60437 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPLO60437 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPLO60437 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPLO60437 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPLO60437 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PPLO60437 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPLO60437 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPLO60437 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPLO60437 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPLO60437 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPLO60437 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPLO60437 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPLO60437 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPLO60437 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPLO60437 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PPLO60437 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPLO60437 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPLO60437 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PPLO60437 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPLO60437 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PPLO60437 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPLO60437 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPLO60437 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPLO60437 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPLO60437 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPLO60437 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPLO60437 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPLO60437 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPLO60437 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PPLO60437 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPLO60437 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPLO60437 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPLO60437 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPLO60437 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPLO60437 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PPLO60437 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPLO60437 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PPLO60437 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPLO60437 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPLO60437 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PPLO60437 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPLO60437 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPLO60437 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPLO60437 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPLO60437 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPLO60437 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPLO60437 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPLO60437 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPLO60437 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPLO60437 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPLO60437 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPLO60437 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PPLO60437 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPLO60437 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPLO60437 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPLO60437 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPLO60437 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPLO60437 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPLO60437 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPLO60437 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPLO60437 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPLO60437 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PPLO60437 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPLO60437 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPLO60437 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PPLO60437 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PPLO60437 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPLO60437 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPLO60437 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PPLO60437 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PPLO60437 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPLO60437 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPLO60437 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPLO60437 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPLO60437 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PPLO60437 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PPLO60437 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PPLO60437 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPLO60437 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPLO60437 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPLO60437 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPLO60437 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPLO60437 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPLO60437 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPLO60437 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPLO60437 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPLO60437 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PPLO60437 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPLO60437 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPLO60437 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PPLO60437 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPLO60437 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PPLO60437 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPLO60437 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPLO60437 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPLO60437 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms