Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN3BO60391 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms