Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SPAG9O60271 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SPAG9O60271 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms