Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms