Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SGTAO43765 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGTAO43765 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGTAO43765 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SGTAO43765 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGTAO43765 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SGTAO43765 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SGTAO43765 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGTAO43765 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGTAO43765 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGTAO43765 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGTAO43765 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGTAO43765 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGTAO43765 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGTAO43765 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGTAO43765 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SGTAO43765 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGTAO43765 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGTAO43765 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGTAO43765 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGTAO43765 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGTAO43765 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGTAO43765 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGTAO43765 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGTAO43765 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGTAO43765 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGTAO43765 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGTAO43765 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGTAO43765 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGTAO43765 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGTAO43765 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGTAO43765 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGTAO43765 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms