Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTIFO43310 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTIFO43310 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTIFO43310 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTIFO43310 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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