Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP3O43295 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRGAP3O43295 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms