Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM6AO15550 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms