Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms