Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms