Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3CA6NKF2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ARID3CA6NKF2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms