Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms