Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J2E0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J2E0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A0A0B4J2E0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms