Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms