Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUBP2Q9Y5Y2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUBP2Q9Y5Y2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUBP2Q9Y5Y2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUBP2Q9Y5Y2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUBP2Q9Y5Y2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUBP2Q9Y5Y2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUBP2Q9Y5Y2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUBP2Q9Y5Y2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUBP2Q9Y5Y2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NUBP2Q9Y5Y2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUBP2Q9Y5Y2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUBP2Q9Y5Y2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUBP2Q9Y5Y2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUBP2Q9Y5Y2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUBP2Q9Y5Y2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUBP2Q9Y5Y2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUBP2Q9Y5Y2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUBP2Q9Y5Y2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUBP2Q9Y5Y2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUBP2Q9Y5Y2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUBP2Q9Y5Y2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUBP2Q9Y5Y2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUBP2Q9Y5Y2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms