Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AFG3L2Q9Y4W6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms