Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN3Q9Y4C0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms