Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y1

POLR3K, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3KQ9Y2Y1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR3KQ9Y2Y1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms