Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MED16Q9Y2X0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms