Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms