Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms