Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLEC4AQ9UMR7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms