Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms