Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN4Q9UJW0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms