Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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