Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STAG3Q9UJ98 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STAG3Q9UJ98 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STAG3Q9UJ98 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STAG3Q9UJ98 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STAG3Q9UJ98 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STAG3Q9UJ98 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms