Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms