Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP68Q9UHB9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms