Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms