Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01513-201ENST00000416930 483 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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