Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAK1IP1Q9NWT1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms