Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms