Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms