Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms