Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN4

GPN1, GPN-loop GTPase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN1Q9HCN4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPN1Q9HCN4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms