Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5DQ9BY66 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5DQ9BY66 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5DQ9BY66 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5DQ9BY66 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5DQ9BY66 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5DQ9BY66 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5DQ9BY66 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5DQ9BY66 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5DQ9BY66 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5DQ9BY66 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5DQ9BY66 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5DQ9BY66 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5DQ9BY66 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5DQ9BY66 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5DQ9BY66 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5DQ9BY66 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5DQ9BY66 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5DQ9BY66 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5DQ9BY66 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms