Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms