Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDHD3Q9BSH5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms