Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD2Q9BSE4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms