Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms