Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms