Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC5LQ99459 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms