Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCC1Q96S66 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms