Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms