Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMTK3Q96Q04 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms